发酵技术国家工程研究中心（简称：工程中心）是由国家发改委批准，由丰原集团、天津大学、江南大学和中科院等离子所共同出资建立的国家多部委认可的发酵技术工程研究中心。工程中心的主要职责是开展菌种技术、发酵技术、分离提取技术、环保处理技术等方面的研究，承担了生物基化学品生物炼制、秸秆生物法制乙醇、自絮凝酵母清液生产乙醇等多项国家863计划项目和省级重点攻关项目。 

工程中心自2003年成立以来，先后承担了国家十一五科技支撑计划项目、国家十二五科技支撑计划项目、国家“863”计划以及省科技攻关计划等，取得了多项优异成果，包括秸秆纤维素转化利用技术，多种有机酸类、氨基酸类、维生素类和生物基材料等产品的生产技术，已取得或在申请重大方法专利技术180多项，主持或参与制定国家标准、行业标准30多项。其中秸秆纤维素制乙醇技术被列入国家科技支撑计划，进入安徽省省部会商机制，5000t/年秸秆纤维素制乙醇产业化示范线通过了省发改委组织的专家论证；省科技攻关项目“以玉米芯为原料生产L-乳酸产业化技术”建成1000t/年产业化示范线并通过了科技厅组织的专家鉴定。 

在工程技术产业化方面，工程中心多项技术已应用到集团新项目中，其中一步发酵法L-苹果酸技术实现国内零的突破，完成国内首条发酵法L-苹果酸生产示范线建设，产品质量和指标优于石油路线和国外企业，解决了长期以来国内只能以石油路线生产DL-苹果酸或石油路线酶转化法生产L-苹果酸的局限，正在实施3万吨/年发酵法L-苹果酸产业化项目。